센터의 최고 의사 결정 기구로서 센터 소장을 위원장으로 하고 연구그룹 책임자 및 총무운영위원을 포함하여 5인 이하로 운영위원회를 구성하고, 센터운영에 필요한 중요사항들(센터 연구 및 교육 방향설정 등 제반 운영에 관한 의사결정, 센터 운영의 종합 평가결과 및 감사에 대한 후속조치 시행, 연구과제의 선정 및 탈락, 연구비 조정, 예산 및 운영에 대한 결정, 연구그룹 업무 분담 협력사항, 심포지움 학술회기획 등)을 논의, 결정한다.

센터 소장을 위원장으로 하고 국내․외 저명학자, 대학병원의 의료관계자, 기업가 등을 위원으로 위촉하여 센터의 연구 방향, 국가생물산업 발전과 관련된 연구센터의 장기계획 수립, 연구센터의 연구 및 교육에 관한 기본방향의 설정, 산․학․연 협력 및 기금 확보방안, 기타 센터 운영 및 기획 등에 대해서 자문한다.

센터의 재무 상태 및 운영 전반을 감사하고 그 결과를 운영위원회에 보고한다.

평가위원회는 센터소장과 자문위원을 중심으로 구성하고, 핵심연구원들의 연구실적과 연구센터사업에 대한 자체평가를 시행한다.

연구센터에 대한 연구관리, 교육훈련, 각종 행사준비를 담당함. 행정요원 1인과 보조인원 1인을 확보하여 모든 사무업무를 전담하여 연세대학교 산학협력단과 연계된 연구비 관리 및 핵심참여연구원들에 대한 센터의 제반 행정업무를 지원한다.